小布,我听说不管什么文献资料你都能搜到?你是怎么做到的?
当然是因为我有独门秘诀“搜神记”啦。它是文献搜集的技巧与方法的集合,学好它,就能成为新一代“搜神”,不管老板让你查什么资料都能分分钟搞定~~~授人以鱼,不如授人以渔,在这里,小布就以检索新型冠状病毒的学术文献和数据资料为例,教你怎样获取最全最新最准的相关学术信息,走近科研工作者的抗疫前线!
新型冠状病毒自2019年12月首次被发现有人类感染以来,疫情形势的变化引发了全球范围的关注,也牵动着亿万民众的心,同时研究者们把论文写在抗击疫情的第一线,各大国际期刊及数字平台上的相关学术资源正大规模涌现。
关键时期我们更要相信科学的力量,知己知彼,方能百战百胜。学者们对病毒研究地越透彻,越有助于调整疫情防治方案、更好地控制疫情。
目前有些数据库已陆续推出该疾病的防治、心理健康指导等方面的书籍。比如,易阅通电子书平台和书香中国互联网数字图书馆均已针对性推出“新型冠状病毒肺炎防控专题”,从防治、心理健康等角度提出了指导。
下面,小布将分五个步骤来介绍本次文献搜集、整理过程。
冠状病毒属于冠状病毒科、冠状病毒属,是自然界广泛存在的一大类病毒。此次在武汉首先发现的冠状病毒被WHO命名为2019新型冠状病毒(2019-nCoV)。目前研究主要集中在生物医学领域。由于疫情初次报道为2019年12月,所以近阶段,重点关注一个多月以来,期刊和生物医学网站的相关文献。
除WHO命名的2019新型冠状病毒(2019-nCoV)以外,通过浏览国内外政府网站、生物医学网站、媒体报道等有关2019年新型冠状病毒的信息,我们初步确定检索词和检索式。若疾病表述随研究而变化,请修改检索词。
检索词中文表述有:2019新型冠状病毒/新型冠状病毒/新型肺炎/新冠肺炎/新冠病毒肺炎/武汉肺炎/武汉新型肺炎/武汉病毒性肺炎等。
检索词外文表述有:2019-nCoV/nCoV/novel coronavirus/new coronavirus/China coronavirus/new China virus/Wuhan virus/novel chinese virus/newly identified coronavirus等。
根据以上检索词,初步拟定检索式如下:
中文检索式
SU='2019新型冠状病毒' OR '新型冠状病毒' OR '新型肺炎' OR '新冠肺炎' OR '新冠病毒肺炎' OR '武汉肺炎' OR '武汉新型肺炎' OR '武汉病毒性肺炎' OR nCoV
英文检索式
SU=nCoV OR “2019-nCoV” OR “novel coronavirus*” OR “new coronavirus*” OR “China coronavirus*” OR “new China virus*” OR “Wuhan virus*” OR “novel chinese virus*” OR “newly identified coronavirus*”
根据本研究的学科特点和疾病的时间发展特点,可以先通过学术发现系统进行一站式搜索,了解概况;然后在能快速反映学术研究的综合性数据库和专业数据库中查找;此外,生物医学的开放获取资源(如预印本平台等)能较快发布相关研究,也是快速获取研究信息的工具。
通过武汉大学图书馆的学术发现系统“珞珈学术搜索”进行一站式检索。学术发现系统除了能帮助研究者一站式发现相关研究文献外,还能为后续更全面地选择检索所需的数据库提供参考。
下图是珞珈学术搜索查找出相关文献的图示。
下图显示了珞珈学术搜索中检出文献在不同数据库中的文献分布数量,据此可初步了解哪些数据库中该主题研究较多,为数据库的选择提供了思路,后续可进一步利用这些数据库进行检索。
考虑到本研究的学科特性,重点选取综合性全文数据库和权威的二次文献数据库。
举个例子,在中国知网中用“新型冠状病毒”在主题字段中查找,主要在期刊和报纸中有相关文献。其中,关于2019年新型肺炎的期刊文献有26篇。
外文数据库实例,通过Wiley Online Library检索后,可检索到19篇相关文献。
我馆订购的生物医学专业数据库,包括一次文献库和二次文献库,均能查找到相关文献。
对于专业数据库的选择,可以借助图书馆的数据库导航功能,该导航可按学科推荐相关专业的数据库。针对本研究,在数据库导航中,重点选择生物学科分类库和医学学科分类库,使重要的专业数据库不遗漏。
下图为数据库导航推荐的部分医学学科数据库。选择生物学科,同样可查看生物相关专业数据库。
目前我馆订购的下列生物医学专业数据库中均有与本研究相关的文献。
例如,EMBASE数据库是全球权威性的生物医学与药理学文摘数据库,在题名中查找,已收录12篇相关文献。
目前生物医学或相关学科的开放获取资源较多,无论是文献还是数据,都在很大程度上实现了学术成果的共享和研究。
国家科技图书文献中心(NSTL)以NSTL馆藏资源为基础,遴选了国内外呼吸道传染病相关的文献,同时也包括目前已经发表的最新新冠病毒相关文献。文献类型包括中外文期刊、会议录、学位论文、权威报道等,面向中国大陆用户提供全文。
Pub Med Central ( PMC ) 是美国国立卫生研究院下属的美国国立医学图书馆开发的生物医学文献数据库。PMC提供部分免费及付费全文链接服务, 如免费的MEDLINE及其他相关数据库接入服务。
预印本平台是基于互联网的新型数字学术交流系统和学术出版平台,bioRxiv(生物预印本)、medRxiv(医学预印本)、ChemRxiv(化学预印本)等预印本平台,近期快速发布了研究新型冠状病毒的文章。需要特别说明的是,预印本平台论文不经过同行评审,发表速度快,但论文质量控制机制不如正式出版物,利用预印本资源时需要谨慎判断。
此外,还有一些病毒资源库或基因数据库。例如,2019新型冠状病毒资源库(https://bigd.big.ac.cn/ncov/),收录了来源于NCBI的GenBank数据库和GISAID数据库发布的2019新型冠状病毒(2019-nCoV)病毒株的株名、采样日期、采样地点、样本提供单位、数据递交单位等元信息。GenBank序列数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/)可查找新型冠状病毒的基因组数据。全球流感序列数据库(GISAID)(https://www.gisaid.org/)收录流感病毒基因序列,以及相关病毒学、临床、流行病学和人口统计学信息,包括本次新型冠状病毒基因组信息的共享。
以bioRxiv为例,从主题途径查找,已有38篇相关文献。
从检索结果看,目前在综合性数据库和专业数据库,以及预印本等开放网站均有相关文献的发布,而且文献呈现出每日增长的趋势。一部分文献发表在Nature,Nature Medcine,Lancet,Journal of Medical Virology,Eurosurveillance等期刊上。预印本服务器上和医学免费网站上也有较多文献发布。
目前检出的结果中,中文文献主要是关于新型冠状病毒疾病的预防、临床特征、治疗等,外文文献主要是研究新型冠状病毒的起源、流行病学和临床特征、感染和免疫反应、传播途径、病毒结构或基因组数据等。
由于本次新型冠状肺炎2019年12月才有报道,如果希望查看最新的研究成果,将查出的结果,按照时间降序排列即可。
用“2019新型冠状病毒”及其相关词检索,可查找到近一个多月的最新研究成果。对于研究者而言,如果希望了解更多文献或查找冠状病毒以前的文献,可采取的扩大检索范围的策略包括:
(1)使用概念更宽泛的词,例如中文用“冠状病毒”,英文用“coronavirus*“检索。
(2)调整检索字段,如从题名字段,调整为主题字段,甚至全文字段。
(3)查看相关参考文献。参考文献反映了研究的引用和继承关系。为了获取更多的相关文献,可以参看上述检索结果的参考文献,进一步获取研究文献。
(4)关注更多的学科领域。目前论文以生物医学为主,疫情过后,可能会有更多领域会着手相关研究,如与疾病相关的公共管理,疫情与心理健康等等。
(5)关注更多文献类型。目前主要关注近期的最新文献,以期刊论文和网上资源为主。未来,还会有会议论文、学位论文、专利等更多类型的文献产生。作为研究者而言,查找文献则需要更广泛地查找,获得更为广阔的视野。
相反,如果研究者希望获得更精确的检索结果,或者是权威的学术文献,可采取的策略包括:
(1)尽量将检索词放在题名或关键词中检索。
(2)英文采用短语检索,例如:“novel coronavirus” 。
(3)检索结果限定文献类型为研究型文献。目前阶段,尽量选择学术期刊文献,甚至是同行评审的期刊文献中的研究论文。由于很多数据库都含有多种文献类型,查出来的有些文献,有可能是相关新闻报道或评论文章等内容。例如在nature电子期刊数据库上用nCoV查出的文献中,News有7篇,Editorial有4篇,Comments and Opinion有2篇,Research有2篇,Research Highlights有1篇。重点要阅读其中类型为Research的文献。
(4)选择权威数据库中的文献。权威数据库中的文献经过甄选,如WOS平台收录的文献。
预计未来新型冠状病毒方面的文献会呈现较快增长。研究者需要有一个高效的文献管理工具软件。NoteExpress是目前较流行的参考文献管理工具软件,可帮助研究者在整个科研流程中高效利用电子资源:检索并管理得到的文献摘要、全文;在撰写论文时,方便地引用并自动生成参考文献索引。
研究者如需持续获取最新研究成果,可以利用数据库的邮件通告(EMAIL-ALERT)功能。如Wiley Online Library,Elsevier SDOS,Springer等数据库,在注册并储存检索策略后,数据库可以定期将研究者感兴趣的领域或检索式相关的最新文献推送到注册的邮箱。
在万众一心抗击疫情的日子里,本文抛砖引玉,希望研究者能较快较全获取关于新型冠状病毒的最新研究文献和数据,把论文写在抗击疫情的第一线,把研究成果应用到战胜疫情中。
本文提到的珞珈学术搜索系统、综合性和专业数据库,武汉大学师生均可以通过校外方式进行访问,详细使用方式可参照武汉大学图书馆微信公众号推文“‘鼠’于你的假期数据库校外访问指南!”。另外,更多检索技巧和方法,可参看图书馆微信菜单“信息服务”—“新生必修课”,或武大图书馆主页上的“小布微课”。
为了支持抗击疫情,知网、维普、万方、Springer Nature,Elsevier,Wiley Online Library等超过20个数据库开通了免费使用,或建立了新型冠状病毒相关专题,预计未来免费开放的数据库还会增多。感兴趣的读者可以浏览今日第二篇推文“精选 | 22个新冠病毒免费数据库,助你把论文写在战胜疫情第一线”。同时,为方便大家使用,我馆将陆续把这些免费资源放到图书馆数据库资源导航中的“网络免费学术资源”栏目,欢迎大家访问。
最后,衷心祝福大家
元宵节平安快乐!
武汉加油!小布加油!
作者:贾娜
(作品选自活动:征集|没有一个冬天不可逾越)
征集活动仍在继续,欢迎投稿!
文字:胡永生
编排:韩慧杰 凃艳玲
封面来自网络
投稿邮箱:xctg@lib.whu.edu.cn